Aplacaidean iMed Web Leabhar-làimhe Cleachdaiche Iarrtas

Leabhar-làimhe cleachdaiche iMed

Ro-ràdh

1.1. Adhbhar
An adhbhar seo web Is e an tagradh fiosrachadh amh a ghabhail agus leigeil leis a làimhseachadh ann an dòigh a bheir seachad toraidhean a tha feumail ann a bhith a’ dèanamh cho-dhùnaidhean. Faodaidh seo a bhith airson modail a thrèanadh le dàta amh no ro-innse a’ bhuil a’ cleachdadh mhodailean agus mion-sgrùdadh.
1.2. Clàr-taice seòlaidh
Anns a’ chlàr seòlaidh aig mullach na duilleige tha na ceanglaichean gu lèir gus faighinn gu far am feum thu a bhith. Ma thèid thu air chall a-riamh, faodaidh tu an-còmhnaidh cliogadh air an t-saighead chùil gus faighinn gu duilleag air a bheil thu eòlach, a dhol air ais dhachaigh, no an duilleag a tha thu a’ lorg a lorg sa chlàr seòlaidh.
1.3. Cunntas
Mura h-eil cunntas agad mu thràth, feumaidh tu clàradh gus an tagradh a chleachdadh. Gus sin a dhèanamh, cliog air a’ phutan cunntais gu h-àrd air an làimh dheis agus cliog air clàradh. An uairsin cuir a-steach d’ ainm-cleachdaidh, facal-faire, agus post-d gus a dhol air adhart.

Ma tha cunntas agad mu thràth, clàraich a-steach leis an ainm-cleachdaidh agus am facal-faire agad.

Duilleag-dhachaigh

Le bhith a’ briogadh air na nithean air taobh clì na duilleige, nochdaidh tuairisgeul air gach fear ann am meadhan na duilleige gus do chuideachadh le bhith a’ tuigsinn na bhios gach fear a’ dèanamh.

iMedBot

Tha an tagradh iMedBot a’ taisbeanadh eadar-aghaidh a bhrosnaicheas eadar-obrachadh furasta le luchd-cleachdaidh le riochdairean, a’ comasachadh ro-innse pearsanaichte agus trèanadh modail. Tha e mar a’ chiad cheum a dh’ ionnsaigh builean rannsachadh ionnsachaidh domhainn a thionndadh gu inneal air-loidhne, aig a bheil comas cur-seachadan rannsachaidh a bharrachd a bhrosnachadh san raon seo. Gheibhear an leabhar-làimhe cleachdaiche aige an seo.

Mion-sgrùdadh Dàta

4.1. Faigh air ais subsets
Leigidh an earrann seo leis an neach-cleachdaidh an stòr-dàta aca a dheasachadh. Faodaidh tu taghadh an dàrna cuid stòr-dàta ùr a luchdachadh suas no fear a tha ann mu thràth a chleachdadh bhon chlàr tuiteam-sìos.

Aon uair ‘s gu bheil an dàta air a luchdachadh suas, faodaidh tu taghadh dè an gnìomh a bu mhath leat a dhèanamh le bhith a’ cliogadh air aon de na roghainnean air a ’chlàr taobh chlì.
4.1.1. Faigh air ais fo-sheataichean stèidhichte air sìoltachain
Leigidh an earrann seo leat fo-sheata nas lugha fhaighinn den t-seata-dàta tùsail stèidhichte air sìoltachain sònraichte. Tagh na luachan a tha thu ag iarraidh san fho-sheata agus an uairsin tagh na colbhan a tha thu airson a shealltainn anns an t-seata dàta mu dheireadh.

4.1.2. Till Toraidhean air an òrdachadh
Bidh seo a’ tilleadh an dàta ann an cruth a chaidh a sheòrsachadh. Tagh an colbh targaid, òrdugh seòrsachaidh, an àireamh de shreathan ri tilleadh, agus dè na colbhan a sheallas san toradh deireannach.

4.1.3. Leudaich an t-seata dàta
Leigidh seo leis an neach-cleachdaidh colbh singilte a tha air a stòradh mar fhaclair a leudachadh gu clàr fìor a dh’ fhaodas an neach-cleachdaidh an uairsin a làimhseachadh. Gabhaidh e stòr-dàta neadachaidh agus gluaisidh e na tha a dhìth air an neach-cleachdaidh a-steach don t-sreath as àirde. An toiseach, luchdaich suas stòr-dàta anns a bheil colbh le stòr-dàta neadachaidh. Ma lorgar colbh a dh’ fheumas leudachadh gu fèin-obrachail, tagh dè an colbh a thèid a leudachadh agus dè na colbhan a tharraingeas bhon fhiosrachadh neadachaidh. Cliog air cuir a-steach agus faodaidh tu view am fiosrachadh agad mar cholbhan de bhòrd an àite dàta neadachaidh.
4.2. Co-aonadh Files
Le bhith a’ taghadh agus a’ luchdachadh suas iomadh dàta le bhith a’ briogadh ctrl (òrdugh airson mac), cuiridh seo iad còmhla ann an aon stòr-dàta nas motha na thèid a chleachdadh airson rudeigin eile.

Dìreach tagh a h-uile dàta dàta agus lìon a-steach am fiosrachadh a tha a dhìth. Sàbhalaidh seo an dàta ùr don tagradh iMed agus bidh e an uairsin ri luchdachadh sìos.
4.3. Gnìomhan Cuilbheart
Leigidh an earrann seo leis an neach-cleachdaidh an stòr-dàta aca a dhealbhadh. Tagh aon de na roghainnean air a’ chlàr air an taobh chlì agus an uairsin lìon a-steach na raointean a tha a dhìth gus do chuilbheart fhaighinn. Gu h-ìosal tha na seòrsaichean plotaichean as urrainn dhut a dhèanamh bhon dàta agad:

4.4. Mion-sgrùdadh Staitistigeil
Leigidh an earrann seo leinn deuchainnean staitistigeil a ruith air an dàta againn. Tagh deuchainn airson a ruith bhon chlàr taobh chlì agus lìon na raointean gus na deuchainnean a ruith. Gu h-ìosal tha na seòrsaichean deuchainnean a tha rim faighinn:

ODPAC

5.1. Ionnsaich
Tha tuairisgeul goirid air an duilleag seo air gach seòrsa goireas a tha ri fhaighinn air an duilleag seo. Ma bhriogas tu air a’ phutan aig mullach gach earrainn nì thu ceangal ri duilleag eile a leigeas leis an neach-cleachdaidh barrachd a chleachdadh no ionnsachadh mun chuspair.
5.1.1. Epistasis
Leigidh an duilleag seo leinn MBS a chleachdadh, algairim sgrùdaidh gus ionnsachadh bho dhàta. Gu sònraichte, leigidh e leinn epistasis a sgrùdadh, an eadar-obrachadh eadar dà ghine no barrachd a bheir buaidh air an phenotype. Tha seo feumail airson profile galaran ann an gnè. Chan eil modhan àbhaisteach freagarrach airson làimhseachadh an dàta àrd-mheudach a lorgar ann an sgrùdaidhean comainn genome-wide (GWAS). Tha an algairim Multiple Beam Search (MBS) a’ ceadachadh ginean eadar-ghnìomhach a lorg aig ìre fada nas luaithe. Luchdaich suas an dàta a tha thu airson a chleachdadh agus an uairsin cuir a-steach na raointean a tha a dhìth. Airson fiosrachadh nas doimhne, lorg am pàipear slàn an seo.

5.1.2. Factaran Cunnairt
Leigidh an duilleag seo leinn pasgan IGain a chleachdadh gus eadar-obrachadh eadar dàta ionnsachadh. Bidh e gu sònraichte ag ionnsachadh eadar-obrachaidhean bho dhàta àrd-mheudach a’ cleachdadh sgrùdadh heuristic. Bidh an dòigh seo a’ togail air an dòigh Exhaustive_IGain a chaidh a leasachadh roimhe seo gus eadar-obrachaidhean ionnsachadh bho dhàta le tomhas ìosal. Luchdaich suas an dàta agus an uairsin cuir a-steach na raointean a tha a dhìth. Gheibhear tuilleadh fiosrachaidh mu stairsnich IS agus iGain an seo.

5.1.3. Modalan ro-innse
Tha an earrann seo a’ ceadachadh modalan ro-innse a chaidh a thogail ro-làimh a bharrachd air modalan ionnsachaidh inneal a chleachdadh gus an cleachdadh a dhèanamh nas luaithe. Leigidh seo leotha an cleachdadh gun a bhith a’ cleachdadh còdadh agus eòlas ro-làimh gus modalan a ro-innse a’ cleachdadh an dàta aca fhèin. Tha grunn mhodalan ro-innse rim faighinn leis an neach-cleachdaidh a’ toirt a-steach Logistic, Regression, Innealan Vector Taic (SVMn), Craobhan Co-dhùnaidh, agus mòran a bharrachd. Gheibhear an làn liosta de dhòighean ro-innse air taobh deas na duilleige an seo.
5.2. Ro-innse
Tha an earrann seo a’ ceadachadh ro-innsean bho mhodail co-roinnte a chaidh a luchdachadh suas roimhe. An toiseach luchdaich suas modal co-roinnte mura h-eil sin air a dhèanamh mar-thà. An uairsin tagh am modail airson a chleachdadh airson ro-innse le bhith a’ briogadh air ainm a’ mhodail. An uairsin luchdaich suas an dàta airson a’ mhodail ro-innse a chleachdadh. Faodar seo a dhèanamh le làimh a’ cleachdadh an fhoirm aig bonn na duilleige no a’ cleachdadh an teamplaid a tha ri fhaighinn airson a luchdachadh sìos. Ma chleachdas tu an teamplaid, luchdaich suas an stòr-dàta file agus cliog air cuir a-steach gus ro-innse a’ mhodail fhaighinn.
5.3. Taic Co-dhùnaidh
Bidh taic co-dhùnaidh a’ toirt seachad seòrsachadh agus faodaidh e roghainnean làimhseachaidh a stiùireadh bhon fhiosrachadh a chaidh a thoirt don t-siostam. Chaidh a thrèanadh bho dhàta gus am modh làimhseachaidh as fheàrr a mholadh stèidhichte air feartan euslainteach. Gheibhear tuilleadh fiosrachaidh a thaobh Siostaman Taic Co-dhùnaidhean Clionaigeach (CDSS) an seo.
Bidh Moladh an t-Siostaim a’ toirt feartan euslainteach agus a’ moladh modh làimhseachaidh agus a’ ro-innse coltachd metastasis 5 bliadhna san àm ri teachd. Bidh an Eadar-theachd Cleachdaiche a’ gabhail gach cuid feartan an euslaintich agus an dòigh làimhseachaidh gus ro-innse a dhèanamh air coltachd metastasis 5 bliadhna san àm ri teachd stèidhichte air làimhseachadh gnàthach an àite an làimhseachadh as fheàrr.

MBIL

Tha an Markov Blanket agus Neach-ionnsachaidh Factor Cunnairt Eadar-ghnìomhach (MBIL) na algairim a bhios ag ionnsachadh factaran cunnairt singilte agus eadar-ghnìomhach aig a bheil buaidh dhìreach air toradh euslainteach. Cliog air “rach gu MBIL” gus a bhith air ath-stiùireadh gu Clàr-innse Pasgan Python (PyPI) airson a’ phacaid MBIL a tha suidhichte an seo. Gheibhear tuilleadh fiosrachaidh mu MBIL aig BMC Bioinformatics.

Stòr-dàta

Tha an earrann seo a’ leigeil leis an neach-cleachdaidh dàta ùr fhaicinn agus a luchdachadh suas gu an web tagradh.
7.1. Faic a h-uile stòr-dàta a tha ri fhaighinn
Gus a h-uile stòr-dàta a tha ri fhaighinn fhaicinn, dìreach cliog air “Show Available Datasets.”

7.2. Luchdaich suas stòr-dàta
Gus stòr-dàta a luchdachadh suas, cliog air “Share Your Datasets” agus an uairsin lìon a-steach am fiosrachadh a tha a dhìth mar a tha air a ràdh air an duilleag fiosrachaidh webduilleag. An toiseach, luchdaich suas an dàta agus lìon na raointean riatanach.

An uairsin, lìon a-steach na raointean gu h-ìosal no luchdaich suas teacsa file leis an fhiosrachadh air a lìonadh a-steachampTha fiosrachadh gu h-ìosal air mar a chuireas tu am fiosrachadh air dòigh gus an tuig an tagradh e.

Modailean

Leigidh an earrann seo leis an neach-cleachdaidh na modailean a tha rim faighinn dhaibh fhaicinn agus modal a cho-roinn.
8.1. Faic a h-uile modal ri fhaighinn
Gus a h-uile modal a tha ri fhaighinn fhaicinn, cliog air “Show Available Models.”

8.2. Roinn Modail
Gus modal a cho-roinn, cliog air “Share Your Models” agus an uairsin luchdaich suas modail file air a thrèanadh le sruthadh tensor no PyTorch.

8.2.1. Stòr-dàta co-cheangailte
Bu chòir dhut an uairsin an dàta co-cheangailte a luchdachadh suas anns a bheil na cinn-cinn. Bu chòir an clas/leubail airson an dàta a bhith sa cholbh mu dheireadh.

8.2.2. Luchd-aithris agus fiosrachadh clas
Ma tha an stòr-dàta a’ toirt a-steach na feartan gu lèir, faodar am foirm feart a leum às deidh dhut an dàta a luchdachadh suas. Ach, mura h-eil iad uile air an toirt a-steach, feumar am fiosrachadh seo a thoirt seachad san tuairisgeul file no taobh a-staigh an fhoirm feart. Tagh an roghainn bhon tuiteam-sìos a’ sealltainn mar a tha thu am beachd an ro-innsearan agus fiosrachadh clas a thoirt seachad.

Ma chleachdas tu an roghainn tuairisgeul, faodaidh tu na raointean a lìonadh a-steach no teacsa a luchdachadh suas file leis an fhiosrachadh air a lìonadh a-steachampTha fiosrachadh mu mar a chuireas tu am fiosrachadh air dòigh air a thoirt seachad gu h-ìosal.